根据提供的资料，美国能源部联邦能源管理计划（FEMP）下的协助联邦设施节能技术项目（AFFECT）明确为美国政府拥有的设施提供能效和水效升级项目的资助。资料中多次强调该项目支持的是“U.S. federal government-owned facilities”（美国联邦政府拥有的设施），并指出其通过直接资金向联邦机构提供支持。
关于读者关心的核心问题：AFFECT 项目是否接受非联邦政府拥有的商业写字楼作为合作伙伴参与能效改造？依据现有完整来源，资料中未提及该计划向非联邦政府拥有的商业写字楼开放。所有列出的资助历史（如 AFFECT IIJA、2022 年等）均限定为“federal agency projects”（联邦机构项目），且明确针对政府拥有的设施。
因此，基于本次实读资料，无法确认或推断出该计划接受非联邦政府拥有的商业写字楼参与。若需获取此类信息，建议直接咨询 FEMP 或查阅其官方最新政策文件，因为当前提供的文本仅涵盖政府自有设施的资助情况。